高橋慶太郎が描く武器商人ココと少年兵ヨナの物語『ヨルムンガンド』を原作とするテレビアニメシリーズの第二期であり完結編。第一期と同じスタッフ・キャストが見せる結末とは？国際的武器運送会社HCLIのヨーロッパ・アフリカ兵器運搬部門に所属する武器商人のココ・ヘクマティアルは、９人の私兵とともに世界の紛争地域でビジネスを展開していた。戦争で両親を失い武器そのものを憎む少年兵ヨナは、ひょんなことからココの私兵となり世界各地を駆けめぐる日々を送っていたが、ココが天才科学者の天田南博士とある計画を進めていることを知ってしまい…。